Første fossilt DNA ekstrahert fra eggeskall

Gensekvenser som er bedre bevart i skallmatrise enn i fossile bein

Løp fugler, jaget av våre forfedre © Heinrich Harder (1920)
lese høyt

For første gang har det vært mulig å trekke ut fossilt DNA fra eggeskallene til utdødde fugler. Det opptil 19 000 år gamle genomet viste seg å være bedre bevart selv under ugunstige miljøforhold enn i bein. Som rapportert av det internasjonale forskerteamet i tidsskriftet Proceedings of the Royal Society B, ble DNA fra den tre meter lange elefantfuglen, som døde ut for over 1000 år siden, også sekvensert for første gang.

Under utgravninger møter paleontologer ofte eggeskall fra dagens utdødde fuglearter. De er vanligvis velkomne verktøy for radio-karbon-datering av stedene eller klassifisering av tidligere naturtyper, siden biomolekylene i dette skallet av kalsiumkarbonat og organisk matrise vanligvis er ganske godt bevart. Men en utvinning av DNA fra et fossilt eggeskall mislyktes så langt. I mange tilfeller var det derfor ikke mulig med en nøyaktig artsoppgave av fossile eggskjell.

Utdøde ratites som eksperimentelle objekter

Men nå er det et middel. For et internasjonalt forskerteam ledet av Michael Bunce fra det australske Murdoch University har nå lyktes for første gang utvinning av DNA fra pulverisert eggeskall. De oppnådde dette ved hjelp av en ny kombinasjon av flere isolasjons- og behandlingsmetoder. "I mange år har forskere uten hell forsøkt å isolere DNA fra fossile eggskjell - nå viser det at de brukte en metode som rett og slett ikke var egnet for eggeskall, " forklarer Charlotte Oskam ved Murdoch University. "Vi ble overrasket over hvor godt det primordiale DNAet ble bevart i de fossile eggskjellene."

Egg av elefantfuglen som døde ut for over 1000 år siden © gemeinfrei

Testobjektene for ekstraksjonen var 18 fossile eggskjell fra Australia, New Zealand og Madagaskar, hvorav noen ble hentet direkte fra steder, hvorav noen ble lagret i museumssamlinger. Eggene kom fra utdødde kjempefugler som Moa (Dinornis sp., Tordenfuglen (Genyornis) eller elefantfuglen (Aepyornis sp.), Men noen var ikke identifisert ennå.) Skallenes alder var opp til 19.000 år.

DNA er bevart bedre enn i fossile bein

Den nye metoden tillot ikke bare forskere å trekke ut og tilordne DNA fra alle tidligere kjente arter fra eggeskallene, men også å identifisere skjellene til tidligere ukjente arter. Dette var spesielt spennende fordi selv om skjellene hadde blitt lagret under ekstremt ugunstige betingelser for konservering, ville de fremdeles avslørt gensekvensene. I følge forskerne antyder dette at eggeskallene tilsynelatende er bedre forberedt på nedbrytning av biomolekyler enn for eksempel bein, den klassiske kilden til ekstraksjon av fossilt DNA. utstilling

Første gensekvenser vunnet av den største fuglen

For første gang vant forskerne også gener fra den tyngste fuglen som noensinne har levd, elefantfuglen Aepyornis. Han nådde en hodehøyde på nesten tre meter og en vekt på 450 kilo. Den flygeløse rotta ble sannsynligvis utryddet på 1000-tallet som et resultat av jakt av mennesker. Utvinningsforsøk fra bein fra steder i Madagaskar og Australia har alltid mislyktes.

Som et neste trinn ønsker forskerne nå å analysere andre eggeskall fra arkeologiske steder på New Zealand. De håper at dette vil belyse hvordan menneskene interagerte med den utdødde fuglen Moa for 600 år siden og hvilken rolle de spilte for utryddelsen.

(Murdoch University, 16.03.2010 - NPO)